机械帝国与人类的第二次战争爆发在李芷宇宙，是卡洛和刘媛派遣的超级战士分头进入李芷宇宙，突然袭击王勇行星造成的。王勇所居住的行星是以前的李芷行星，占领之后，他将这座行星改名为王勇行星，并且在那里为超级计算机机械之神和自己建造了大型的智能住宅机械宫。在这座宫殿式的建筑里，王勇设置了非常复杂的高科技防卫措施，可以说，机械宫的主体根本就是一艘大型的太空飞船。当机械宫本身遭到外敌袭击之时，它可以携带机械之神和王勇的卧室飞向太空，在机械宫的地下室里，是一个巨大的核动力引擎，平时可以用来为机械宫提供日常的电力和武器系统能源，在作为太空飞船启动的时候，它就是机械宫的主动力引擎，其充沛的输出能量可以一直将飞船速度在几秒钟内提升至接近光速。
卡洛和刘媛派遣来的超能超级战士对于机械宫的袭击并没有凑效，机械宫附近利用射电雷达形成的预警网探测到了前来袭击的敌人，并且迅速通知了机械之神计算机。超级计算机则及时发布了军队动员令，将周围星群的机械帝国超级战士军队迅速集合到王勇行星，迎击前来侵犯的人类超级战士。由于人类超级战士属于最先进的超能超级战士，虽然将增援的机械超级战士打的落花流水，但是进攻机械宫的预谋当然是失败了。王勇驱动机械号巨型太空飞船在离开王勇行星之后又指挥了对人类超级超能能战士的还击，由于他以前曾经是火星超级战士，所以对人类超级战士的弱点和强项一清二楚。在反击当中，人类军队损失了几个超能战士，但是王勇星系被z星人夺回。
卡洛重新占领王勇行星之后，将它重新命名为李芷行星，发现虽然王勇在宇宙中的其它荒芜行星上开采了大量的矿物，但是将李芷行星建设的很优美，甚至于接近人类居住的环境，可能即使是优化基因的克隆人也需要舒适环境吧。回到李芷星系之后，卡洛并没有大规模驻守超级战士，而是仅仅留守了几个超能战士。同时采用了王勇的办法来保卫李芷行星，那就是安置了超级巨型防御计算机和从火星调遣来的大量遥控型机器人战士。在吸引了大部分机械帝国主力部队之后，火星人在李芷宇宙中发现的几颗适宜人类居住的行星上登陆了。
王勇在丢失了李芷行星之后不久，又找到了另外一颗交通比较便利，而且生存环境适宜人类居住的行星，他将其命名为琼星。为了保护琼行星不再遭受到突袭的命运，王勇在琼星的附近设置了驻扎有大量巨型机器人的机械星。而此时的卡洛也开始意识到人类与机械帝国之间较为弱势的主要原因就是机械帝国比人类更加适合于宇宙生活，他决定开始推行一些政策帮助人类学习和更加适应宇宙生存。正如地球人的十八世纪，海洋即意味着财富一样，在银河宇宙所在的二十三世纪，宇宙即意味着能源。
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